Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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