Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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