Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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