Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms