Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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