Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms