Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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