Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms