Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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