Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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