Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNCBQ16143 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNCBQ16143 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNCBQ16143 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNCBQ16143 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SNCBQ16143 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SNCBQ16143 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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