Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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