Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PDCD1Q15116 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDCD1Q15116 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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