Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms