Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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