Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TCOF1Q13428 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TCOF1Q13428 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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