Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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