Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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