Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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