Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TRDNQ13061 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
TRDNQ13061 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRDNQ13061 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms