Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms