Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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