Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NUP160Q12769 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NUP160Q12769 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NUP160Q12769 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NUP160Q12769 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NUP160Q12769 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NUP160Q12769 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms