Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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