Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPREP23469 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPREP23469 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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