Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP9BO43861 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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