Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms