Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN4Q9Y3Q4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms