Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms