Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms