Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GDE1Q9NZC3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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