Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms