Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms