Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI5

NMRK2, Nicotinamide riboside kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK2Q9NPI5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMRK2Q9NPI5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NMRK2Q9NPI5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMRK2Q9NPI5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms