Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms