Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms