Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms