Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms