Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms