Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms