Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP13Q92995 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms