Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRQ92752 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRQ92752 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNRQ92752 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNRQ92752 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRQ92752 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms