Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC117Q8IWD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms