Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms