Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39AQ5SRH9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms