Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms