Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
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