Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
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