Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms