Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms